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Subrogation de l’employeur pour les IJSS : fonctionnement, avantages et mise en place

Sofiane Coly Sofiane Coly
28 mars 2026 4 min de lecture
Subrogation de l’employeur pour les IJSS : fonctionnement, avantages et mise en place

La subrogation de l’employeur dans le versement des IJSS : guide pratique

La subrogation est un mécanisme par lequel l’employeur se substitue au salarié pour percevoir directement les indemnités journalières de la Sécurité sociale (IJSS) versées par la CPAM, en contrepartie du maintien total ou partiel de la rémunération pendant l’arrêt de travail. Ce dispositif, prévu par l’article R. 323-11 du Code de la sécurité sociale, présente des avantages tant pour l’employeur que pour le salarié.

Conditions de la subrogation

L’article R. 323-11 du CSS subordonne la subrogation à une condition essentielle : le salaire maintenu par l’employeur pendant l’arrêt doit être au moins égal au montant des IJSS. Cette condition s’apprécie sur l’ensemble de la période de maintien de salaire.

Subrogation de droit et subrogation conventionnelle

  • Subrogation de droit : lorsque l’employeur maintient le salaire pendant l’arrêt maladie à un niveau au moins égal aux IJSS, il est subrogé de plein droit dans les droits du salarié vis-à-vis de la Sécurité sociale
  • Subrogation conventionnelle : certaines conventions collectives ou accords d’entreprise prévoient expressément la subrogation, en simplifiant les modalités de mise en oeuvre

Mise en place de la subrogation

Les démarches pratiques

Pour mettre en oeuvre la subrogation, l’employeur doit :

  • Effectuer la déclaration sociale nominative (DSN) : depuis la généralisation de la DSN, la signalisation de l’arrêt de travail et la demande de subrogation s’effectuent par voie dématérialisée
  • Indiquer la subrogation dans la DSN lors de la déclaration de l’arrêt de travail (événement « arrêt de travail » avec mention de la subrogation)
  • Préciser la période de subrogation : dates de début et de fin du maintien de salaire
  • Communiquer les éléments de salaire nécessaires au calcul des IJSS

Le rôle de la DSN

La DSN a considérablement simplifié la gestion de la subrogation. L’attestation de salaire dématérialisée transmise via la DSN vaut demande de subrogation dès lors que l’employeur renseigne les dates de la période de subrogation et les coordonnées bancaires de l’entreprise.

Avantages de la subrogation

Pour l’employeur

  • Maîtrise de la trésorerie : perception directe des IJSS, évitant les avances de trésorerie non compensées
  • Simplification de la paie : le maintien de salaire est versé au salarié et les IJSS sont directement perçues par l’employeur
  • Meilleur suivi des arrêts : la subrogation incite à un suivi rigoureux des arrêts et des IJSS

Pour le salarié

  • Continuité de revenu : le salarié perçoit son salaire maintenu sans interruption, sans avoir à attendre le versement des IJSS
  • Simplification administrative : le salarié n’a pas à gérer les versements de la CPAM

Traitement en paie de la subrogation

Le traitement en paie de la subrogation nécessite une attention particulière :

  • Le salaire maintenu figure sur le bulletin de paie comme rémunération brute
  • Les IJSS perçues sont déduites et apparaissent en ligne distincte
  • Le régime social : les IJSS subrogées sont soumises à CSG/CRDS à des taux spécifiques (6,20% de CSG et 0,50% de CRDS sur 100% des IJSS maladie)
  • Le précompte de la CSG/CRDS sur les IJSS est effectué par l’employeur lors de la subrogation

Difficultés et points de vigilance

  • Décalage de trésorerie : les IJSS ne sont pas toujours versées simultanément au maintien de salaire, créant un décalage de trésorerie pour l’employeur
  • Décompte des IJSS : l’employeur doit vérifier le montant des IJSS effectivement versées par la CPAM et procéder aux régularisations nécessaires
  • Fin de la subrogation : lorsque le maintien de salaire prend fin, la subrogation cesse et le salarié perçoit directement les IJSS de la CPAM
  • Arrêts successifs : la gestion des arrêts successifs et des reprises nécessite un suivi précis

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FAQ : Subrogation de l’employeur pour les IJSS

La subrogation est-elle obligatoire ?

Elle est de droit dès que le salaire maintenu est au moins égal aux IJSS. Certaines conventions collectives la rendent explicitement obligatoire.

Comment déclarer la subrogation en DSN ?

Lors de la signalisation de l’arrêt, renseigner les dates de subrogation et les coordonnées bancaires de l’entreprise.

Que faire si la CPAM verse directement au salarié ?

Contacter la CPAM pour rectification et, si nécessaire, déduire les IJSS sur la paie suivante après information du salarié.

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